| 预测新的生物胺受体配基结合位点 |
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| 引用本文： | 郭志云,熊莉丽,茆灿泉,王万军.预测新的生物胺受体配基结合位点[J].四川大学学报(自然科学版),2008,45(1):175-181. |
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| 作者姓名： | 郭志云 熊莉丽 茆灿泉 王万军 |
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| 作者单位： | 西南交通大学生物工程学院;西南交通大学生物工程学院;西南交通大学生物工程学院;西南交通大学生物工程学院 |
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| 摘 要： | 生物胺受体被认为是一类重要的药物靶标,用生物信息学手段寻找它的配基结合位点并分析其功能,对于药物设计具有重要的指导意义.从整体上结合可变性、疏水性和保守性构建了受体的2D螺旋横切面模型,预测出其可能的配基结合区Ⅰ、Ⅱ,其中TM3、TM4以及TM7在配基结合中起关键作用,E-Ⅱ环也参与了配基结合这一过程,这是对以往普遍认为只有TM参与配基结合的延伸.从局部上寻找了生物胺受体及其子受体的基序,提出了家族可变亚家族保守基序(motif)概念,即家族可变区中找到的亚家族保守的基序.最后结合整体与局部分析结果分析了各基序的功能,预测了行使配基结合功能的基序及其相应位点,结果证明与突变实验结果有很好的吻合度.
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| 关 键 词： | 生物胺受体 配基 基序 生物信息学 功能 |
The prediction of amine receptors ligand-binding region and sites |
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| GUO Zhi-Yun,XIONG Li-Li,MAO Can-Quan and WANG Wan-Jun.The prediction of amine receptors ligand-binding region and sites[J].Journal of Sichuan University (Natural Science Edition),2008,45(1):175-181. |
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| Authors: | GUO Zhi-Yun XIONG Li-Li MAO Can-Quan and WANG Wan-Jun |
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| Institution: | College of Bioengineering, Southwest Jiaotong University;College of Bioengineering, Southwest Jiaotong University;College of Bioengineering, Southwest Jiaotong University;College of Bioengineering, Southwest Jiaotong University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Amine receptor ligand motif bioinformatics function |
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