| 欧洲山杨bHLH转录因子家族全基因组分析 |
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| 引用本文： | 沈方圆,王岚春,李校.欧洲山杨bHLH转录因子家族全基因组分析[J].四川大学学报(自然科学版),2021,58(3):036003. |
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| 作者姓名： | 沈方圆 王岚春 李校 |
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| 作者单位： | 四川大学生命科学学院 生物资源与生态环境教育部重点实验室,四川大学生命科学学院 生物资源与生态环境教育部重点实验室,四川大学生命科学学院 生物资源与生态环境教育部重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（61001149） |
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| 摘 要： | 为了研究欧洲山杨中bHLH转录因子家族成员的分类和进化,分析其在干旱胁迫应激中可能行使的功能,本研究利用多种生物信息学手段从全基因组水平鉴定和解析欧洲山杨bHLH转录因子,并对干旱胁迫下的欧洲山杨根部转录组进行分析.结果显示,欧洲山杨的基因组中有167个bHLH转录因子家族蛋白.通过与拟南芥bHLH蛋白序列进行系统发育分析将其分为15个亚家族,并推测出39个PtbHLH的功能,这些功能表明bHLH转录因子家族涉及到欧洲山杨生长发育的多个生理过程.基因结构和motif分析显示,同一亚家族中几乎所有的PtbHLH都有相似的外显子/内含子排布和蛋白质motif结构.此外,利用RNA-seq数据分析干旱胁迫处理下PtbHLH基因的表达情况,筛选出4个潜在的bHLH抗旱蛋白.
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| 关 键 词： | 欧洲山杨 bHLH 转录因子 全基因组分析 |
| 收稿时间： | 2020/10/12 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2021/1/23 0:00:00 |
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