| 盐胁迫下拟南芥去乙酰化酶基因的转录组分析 |
| |
| 引用本文： | 欧艺鹏,黄轩雅,陈功春,林娟.盐胁迫下拟南芥去乙酰化酶基因的转录组分析[J].四川大学学报(自然科学版),2022,59(1):180-188. |
| |
| 作者姓名： | 欧艺鹏 黄轩雅 陈功春 林娟 |
| |
| 作者单位： | 复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室,上海200438 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金面上项目(31170287)； |
| |
| 摘 要： | 为了探究盐胁迫下拟南芥HD2去乙酰化酶调控的下游基因,本研究以拟南芥野生型WT和四突(hd2q,HD2四个基因的突变体)为材料,采用RNA-seq技术和生物信息学方法,对生长10 d的幼苗在高盐(150 mmol/L NaCl)处理前和后进行比较转录组分析,并结合实时荧光定量PCR验证转录组数据的可靠性.结果显示:在高盐处理前WT和hd2q共有25个差异基因,其中上调基因2个,下调基因23个.在高盐处理后,WT和hd2q共有1407个差异基因,其中上调基因772个,下调基因635个.GO和KEGG分析显示,对照组的差异基因主要富集在胞外区域和响应脱落酸上,盐处理组的差异基因主要富集在胞外区域和细胞壁上,并且发现有41个与盐响应途径相关的差异基因(27个上调基因,14个下调基因).结果表明拟南芥HD2去乙酰化酶调控下游盐响应基因从而使拟南芥适应盐胁迫环境.
|
| 关 键 词： | 拟南芥 幼苗 转录组 盐处理 HD2去乙酰化酶 |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
|
