甘蓝型油菜矮化突变体的茎秆发育转录组分析 |
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引用本文: | 牛显飞,蒋学飞,解艳芳,刘双双,王茂林.甘蓝型油菜矮化突变体的茎秆发育转录组分析[J].四川大学学报(自然科学版),2018,55(1):0201-0206. |
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作者姓名: | 牛显飞 蒋学飞 解艳芳 刘双双 王茂林 |
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作者单位: | 四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室 |
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基金项目: | 国家重点研发计划(2016YFD010020002),国家科技支撑计划(2013BAD01B03)和“十三五”四川省作物育种攻关项目(16ZC2860) |
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摘 要: | 甘蓝型油菜矮化突变体"NDF-1"是从高秆油菜"3529"理化诱变群体中分离的矮化突变体,它的株高只有高秆亲本的1/3,是一个优良的甘蓝型油菜矮化资源.本文应用RNA-Seq测序技术分析了"NDF-1"茎开始伸长的抽薹期和花期转录组,为深入了解油菜茎秆发育机理提供基因组层面的参考.抽薹期和花期的测序数据通过筛选得到了4.55亿条质量合格的clean reads.经过对高质量序列的组装注释,筛选得到"NDF-1"和"3529"间的2147条差异表达基因(DEGs).选择其中的20个差异表达基因进行了荧光定量PCR验证.通过GO和KEGG分析,发现"NDF-1"的矮化与赤霉素、生长素和油菜素内酯相关,细胞伸长异常和细胞壁的不正常形成也影响"NDF-1"的茎秆发育.从差异基因中筛选出与植物矮化性状相关的基因,为利用矮化基因改善性状和矮化机理的研究和提供了更多信息.
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关 键 词: | 甘蓝型油菜 矮化 茎秆伸长 转录组 |
收稿时间: | 2017/2/27 0:00:00 |
修稿时间: | 2017/4/14 0:00:00 |
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