| 五指山小型猪PMSA6基因cDNA克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 刘涛,申明霞,杜丽,程立生,王凤阳,成鹰,李治深.五指山小型猪PMSA6基因cDNA克隆及生物信息学分析[J].海南大学学报(自然科学版),2009,27(2):134-138,143. |
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| 作者姓名： | 刘涛 申明霞 杜丽 程立生 王凤阳 成鹰 李治深 |
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| 作者单位： | 海南大学农学院,海口市动物基因工程重点实验室,海南海口,570228 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，海南省自然科学基金资助项目，海南省教育厅高校科研资助项目 |
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| 摘 要： | 为了对海南五指山小型猪蛋白酶体亚基α型6（proteasome subunit alpha type 6，PMSA6）cDNA基因进行克隆和生物信息学分析，笔者以构建的五指山小型猪外周血白细胞cDNA文库为材料，采用菌落PCR方法，克隆得到PMSA6全长cDNA，并向GenBank递交了该序列（登录号：FJ358606）．同时运用生物信息学软件对该基因核苷酸序列进行了分析，并预测了其编码蛋白的理化性质及二级结构等．生物信息学分析表明：该cDNA全长1029bp，5’非翻译区长96bp，3’非翻译区长192bp，含有一个741bp完整的开放阅读框，编码246个氨基酸．该蛋白的分子量为37．680kD，等电点为8．76．进一步比对分析发现，五指山小型猪PMSA6基因的核酸序列及其氨基酸序列与人、牛等哺乳动物具有很高的相似性．本研究成功克隆了海南五指山小型猪P肛SA6基因cDNA，并进行了相关生物信息学分析，为进一步研究PMSA6在动物体内的作用机理奠定了基础．
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| 关 键 词： | 五指山小型猪 cDNA文库 蛋白酶体亚基α型6 克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Sequence Analysis of PMSA6 cDNA from Wuzhishan Miniature Pig |
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| LIU Tao,SHEN Ming-xia,DU Li,CHENG Li-sheng,WANG Feng-yang,CHENG Ying,LI Zhi-shen.Cloning and Sequence Analysis of PMSA6 cDNA from Wuzhishan Miniature Pig[J].Natural Science Journal of Hainan University,2009,27(2):134-138,143. |
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| Authors: | LIU Tao SHEN Ming-xia DU Li CHENG Li-sheng WANG Feng-yang CHENG Ying LI Zhi-shen |
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| Institution: | College of Agriculture;Hainan University;Haikou 570228;China |
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| Abstract: | The research aimed to clone full-length cDNA of PMSA6(proteasome subunit alpha type 6)gene of Wuzhishan Miniature Pig and analysis of this gene.A full-length PMSA6 gene cDNA was cloned from the cDNA library of the peripheral blood leucocytes in Wuzhishan Miniature Pig by Colony PCR.The cloned PMSA6 cDNA sequence had been sent to Gen-Bank and got a accession number: FJ358606.The bioinformatic analysis results showed that the PMSA6 cDNA sequence was 1029 bp length,containing an open reading frame of 741 bp,fl... |
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| Keywords: | Wuzhishan Miniature Pig cDNA library PMSA6 cloning bioinformatic analysis |
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