| 阳春砂磷酸甲羟戊酸激酶的基因克隆与表达谱分析 |
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| 引用本文： | 杨恩泽,陆颖锶,吴秋红,王峰.阳春砂磷酸甲羟戊酸激酶的基因克隆与表达谱分析[J].暨南大学学报,2015(2). |
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| 作者姓名： | 杨恩泽 陆颖锶 吴秋红 王峰 |
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| 作者单位： | 暨南大学 药学院 中药药效物质基础及创新药物研究广东省高校重点实验室,广东 广州,510632 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(30700704)；广东省教育厅科技创新项目 |
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| 摘 要： | 目的:为了了解阳春砂磷酸甲羟戊酸激酶(PMK)的功能与表达特性,根据阳春砂的转录组注释设计引物,PCR克隆阳春砂甲羟戊酸途径中的关键酶磷酸甲羟戊酸激酶基因的编码区c DNA,使用生物信息学方法对其编码的蛋白进行相似性检索及同源序列比对,构建进化树,预测二级及三级结构并分析其功能,探索其各器官中的表达差异.结果:获得了全长1 539 bp的编码阳春砂PMK的c DNA序列,命名为Av PMK(Gen Bank登录号:KF569902),编码由512个氨基酸组成的磷酸甲羟戊酸激酶,该蛋白含有GHMP激酶超家族特异的N-保守区域、C-保守区域和ATP结合位点Gly-X-Gly-XX-Ala.Av PMK与其他植物的PMK氨基酸相似性达61%~69%,进化树结果显示其与二穗短柄草(Brachypodium distachyon)等单子叶植物具有较近的亲缘关系.Av PMK蛋白包含14个α-螺旋(Alpha helix),占37.1%;16个β链(Beta strand),占15.6%;32个无规则卷曲结构,占47.3%,无跨膜结构域,其3级结构含有一个催化反应的口袋状结构域.实时荧光定量PCR结果显示Av PMK基因在叶中表达量较高,茎、根中表达量相对较低.结论:首次从阳春砂仁中扩增磷酸甲羟戊酸激酶的基因片段,为分析其基因表达特性及其在砂仁萜类生物合成中的功能奠定基础.
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| 关 键 词： | 磷酸甲羟戊酸激酶 阳春砂 萜类化合物 基因克隆 表达谱分析 |
Cloning and expression profiles analysis of PMK gene in Amomum villosum Lour |
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| YANG Enze,LU Yingsi,WU Qiuhong,WANG Feng.Cloning and expression profiles analysis of PMK gene in Amomum villosum Lour[J].Journal of Jinan University(Natural Science & Medicine Edition),2015(2). |
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| Authors: | YANG Enze LU Yingsi WU Qiuhong WANG Feng |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | phosphomevalonate Kinase(PMK) amomum villosum terpenoids gene cloning expression profiles analysis |
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