膜性肾病差异性表达microRNA的靶基因功能分析 |
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引用本文: | 陈文标,黄建溶,戴勇.膜性肾病差异性表达microRNA的靶基因功能分析[J].暨南大学学报,2014,0(4):381-390. |
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作者姓名: | 陈文标 黄建溶 戴勇 |
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作者单位: | 陈文标 (暨南大学 附属第二医院,深圳市人民医院,临床医学研究中心,广东 深圳518020); 黄建溶 (暨南大学 附属第二医院,深圳市人民医院,临床医学研究中心,广东 深圳518020); 戴勇 (暨南大学 附属第二医院,深圳市人民医院,临床医学研究中心,广东 深圳518020); |
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基金项目: | 深圳市卫生局科技项目(项目编号:201202139) |
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摘 要: | 目的:探讨膜性肾病(MN)差异性表达microRNA的靶基因主要参与的Gene Ontology(GO)富集与Kyoto Encyclopedia Genes And Genomes(KEGG)通路.方法:100例MN患者与100例健康对照者(NC)作为实验对象.100例NC随机分成10组(NC1~10),每组10人.同样100例MN随机分成10组,每组10人(MN1~10).分别从实验参与者静脉采取全血10 mL,来源于静脉血的单个核细胞用于提取RNA.总RNA以组为单位等量混合用于高通量技术测序(high-throughput sequencing),对RNA测序结果进行长度分布,基因比对,RNA分类注释,RNA特有序列及其公共序列分析后,获得小核糖核酸(microRNA)进行MN与NC差异性表达分析来寻找显著表达microRNA.应用相关的软件对差异性表达的microRNA进行靶基因预测,靶基因借助功能注释软件对其参与的生物过程进行GO富集及KEGG通路分析.结果:靶基因在GO富集分析中主要集中在细胞器官组成,细胞膜组成,离子结合,生物代谢过程,生物调节过程等.靶基因在KEGG通路分析中主要参与嘌呤代谢通路,代谢产物生物合成,癌症通路,蛋白激酶信号通路等.结论:MN与NC之间存在着显著差异性表达microRNA.差异性表达的microRNA的靶基因参与的GO富集与KEGG通路可能与MN的发病机制与临床症状有着密切的联系.
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关 键 词: | 膜性肾病 小核糖核酸 靶基因 GO富集 KEGG通路 |
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