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| 蛋白质界面网络中模体和模块的探测 | |
| 引用本文： | 胡尊胜,林锦贤,吕暾.蛋白质界面网络中模体和模块的探测[J].华侨大学学报(自然科学版),2014(1):61-66. |
| 作者姓名： | 胡尊胜 林锦贤 吕暾 |
| 作者单位： | 福州大学数学与计算机科学学院;福州大学生物科学与工程学院 |
| 基金项目： | 国家科技支撑计划项目(2008BAH37B05-040);国家科技人员服务企业行动项目(2009GJC40029) |
| 摘 要： | 基于复杂网络研究蛋白质界面网络中的模体和模块,发现蛋白质界面网络与蛋白质肽链网络的拓扑性质有差异.蛋白质界面网络中的模体类型和数量受截断距离R影响较大,R值不同,网络中的模体类型和数量都有较大差别.蛋白质界面网络中存在模块结构,分析R为0.5,0.7,1.2,2.4nm时网络中存在的3-派系-模块,发现当R为0.7nm时的蛋白质界面网络模块划分比较符合实际.最后,分析蛋白质界面网络中的模块与其拓扑性质的关系,发现界面网络中的节点数与3-派系-模块数呈线性关系. |
| 关 键 词： | 蛋白质 肽链网络 界面网络 模体 模块 拓扑性质 |
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