基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析 |
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引用本文: | 吕利,王晓利,张文娟,韩芝侠.基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析[J].宝鸡文理学院学报(自然科学版),2023(1):54-61. |
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作者姓名: | 吕利 王晓利 张文娟 韩芝侠 |
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作者单位: | 宝鸡文理学院电子电气工程学院 |
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摘 要: | 目的 指出当前已有的基于三代测序数据的基因组组装方法的缺陷,并提出改进措施,以提高组装的准确率与运行效率。方法 深入分析当前基于三代长读长测序技术的基因组组装方法,包括基于“校正后组装”策略的FALCON,Canu和MECAT组装方法,基于“组装后校正”策略的Flye和Wtdbg2组装方法,指出不同策略的优缺点。结果与结论综合2种组装策略的优势,提出了可以融合2种组装策略优势的新的基因组组装方案,解决了当前基于三代测序数据的基因组组装中的难点。
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关 键 词: | 三代测序数据 基因组组装 生物信息学 |
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