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基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析
引用本文:吕利,王晓利,张文娟,韩芝侠.基于三代长读长测序数据的基因组组装算法分析[J].宝鸡文理学院学报(自然科学版),2023(1):54-61.
作者姓名:吕利  王晓利  张文娟  韩芝侠
作者单位:宝鸡文理学院电子电气工程学院
摘    要:目的 指出当前已有的基于三代测序数据的基因组组装方法的缺陷,并提出改进措施,以提高组装的准确率与运行效率。方法 深入分析当前基于三代长读长测序技术的基因组组装方法,包括基于“校正后组装”策略的FALCON,Canu和MECAT组装方法,基于“组装后校正”策略的Flye和Wtdbg2组装方法,指出不同策略的优缺点。结果与结论综合2种组装策略的优势,提出了可以融合2种组装策略优势的新的基因组组装方案,解决了当前基于三代测序数据的基因组组装中的难点。

关 键 词:三代测序数据  基因组组装  生物信息学
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