基于小波分析的蛋白质序列分形研究 |
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引用本文: | 汤丽华.基于小波分析的蛋白质序列分形研究[J].科技信息,2009(33):48-49,133. |
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作者姓名: | 汤丽华 |
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作者单位: | 南京邮电大学地理与生物信息学院,江苏南京210003 |
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摘 要: | 利用氨基酸的疏水自由能对蛋白质序列进行编码,选择墨西哥帽小波对于编码序列进行多尺度分解,应用基于小波分解的Abry—Veitch算法来研究蛋白质一级结构的分形特性,最后通过计算Hurst指数来定量刻画蛋白质序列的自相似性。实验结果表明.本文的方法只依据蛋白质一级序列的信息,可获得反映了蛋白质序列排列的自相似性和复杂度一个判据,相比于其他方法,本文的方法简单、可靠,为蛋白质序列的分析和研究提供了一个新的思路。
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关 键 词: | Abry-Veitch算法 Hurst指数 墨西哥帽小波 分形 |
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