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基于小波分析的蛋白质序列分形研究
引用本文:汤丽华.基于小波分析的蛋白质序列分形研究[J].科技信息,2009(33):48-49,133.
作者姓名:汤丽华
作者单位:南京邮电大学地理与生物信息学院,江苏南京210003
摘    要:利用氨基酸的疏水自由能对蛋白质序列进行编码,选择墨西哥帽小波对于编码序列进行多尺度分解,应用基于小波分解的Abry—Veitch算法来研究蛋白质一级结构的分形特性,最后通过计算Hurst指数来定量刻画蛋白质序列的自相似性。实验结果表明.本文的方法只依据蛋白质一级序列的信息,可获得反映了蛋白质序列排列的自相似性和复杂度一个判据,相比于其他方法,本文的方法简单、可靠,为蛋白质序列的分析和研究提供了一个新的思路。

关 键 词:Abry-Veitch算法  Hurst指数  墨西哥帽小波  分形
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