基于转录组测序的波纹巴非蛤微卫星标记研究 |
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引用本文: | 孙宏,李佳凯,武祥伟,刘坦,刘贤德.基于转录组测序的波纹巴非蛤微卫星标记研究[J].集美大学学报(自然科学版),2015(4). |
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作者姓名: | 孙宏 李佳凯 武祥伟 刘坦 刘贤德 |
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作者单位: | 1. 集美大学水产学院,福建 厦门361021; 农业部东海海水健康养殖重点实验室,福建 厦门361021 2. 福建省海洋渔业资源与生态环境重点实验室,福建 厦门361021; 云南农业大学动物科学技术学院,云南 昆明650201 |
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基金项目: | 国家自然科学基金,福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划,福建省海洋渔业资源与生态环境重点实验室开放基金,福建省大学生创新创业训练计划项目 |
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摘 要: | 应用MISA软件对波纹巴非蛤转录组测序数据进行分析,共获得7378个微卫星标记,从中选取95个位点设计引物,并在一个野生波纹巴非蛤群体中进行分析验证,结果显示:95个位点中能够扩增出清晰条带的位点有30个,其中15个位点表现为单态,15个位点呈现多态.使用15个多态位点进行波纹巴非蛤群体的遗传多样性分析,结果表明:这15个位点的等位基因数为2~9,平均等位基因数为4.733,平均有效等位基因数为2.438,平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.270、0.516,平均多态信息含量为0.457.
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关 键 词: | 波纹巴非蛤 转录组 微卫星标记 遗传多样性 |
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