基于树核的蛋白质相互作用关系提取的研究 |
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引用本文: | 刘念,马长林,张勇,王梦.基于树核的蛋白质相互作用关系提取的研究[J].华中科技大学学报(自然科学版),2013(Z2):232-236. |
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作者姓名: | 刘念 马长林 张勇 王梦 |
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作者单位: | 华中师范大学计算机学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(61202470) |
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摘 要: | 蛋白质相互作用关系对理解生物过程具有非常重要的意义,为了解决同位语依存关系带来的噪音干扰,提出了一个改进的基于树核的PPI提取方法,通过定义一些相关的处理规则来有效优化两个蛋白质之间的最短依存路径,在此基础上,用有效优化路径来指导成分句法树的裁剪,使得用于PPI提取的成分树更加精确和简洁.实验结果表明:用有效优化路径指导的成分句法树在五个常用的语料库上都取得了较好的效果.
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关 键 词: | 蛋白质 关系提取 提取方法 同位语依存关系 树核 |
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