| 基于高通量测序分析白云岩喀斯特土壤微生物多样性 |
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| 引用本文： | 唐婧,李欲轲,何馨竹,汤晓辛.基于高通量测序分析白云岩喀斯特土壤微生物多样性[J].贵州师范大学学报(自然科学版),2020,38(5):20-28. |
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| 作者姓名： | 唐婧 李欲轲 何馨竹 汤晓辛 |
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| 作者单位： | 贵州师范大学贵州省植物生理与发育重点实验室/生命科学学院,贵州贵阳 550001,贵州师范大学贵州省植物生理与发育重点实验室/生命科学学院,贵州贵阳 550001,贵州师范大学贵州省植物生理与发育重点实验室/生命科学学院,贵州贵阳 550001,贵州师范大学贵州省植物生理与发育重点实验室/生命科学学院,贵州贵阳 550001 |
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| 基金项目： | 贵州省科技合作项目;贵州省重点实验室项目;贵州师范大学博士科研资助项目;教育部长江学者和创新团队发展计划资助 |
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| 摘 要： | 利用白云岩喀斯特土壤微生物16S rRNA V4及ITS1区的高通量测序数据,分析土壤微生物群落结构特征。基于PICRUSt算法预测土壤微生物群落功能基因组,应用皮尔逊相关系数解析土壤性质与土壤微生物群落多样性及代谢通路的相关性。结果显示:白云岩喀斯特土壤微生物主要分布于15个菌门,其中以变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)和接合菌门(Zygomycota)为最主要的优势菌门。基于PICRUSt功能基因预测,共获得6 208个同源功能基因(KEGG Orthology),富集于311条代谢通路(metabolism pathway)。其中与氨基酸代谢、碳水化合物代谢等有关的基因在种类和数量上都占预测功能基因中的绝对优势。相关性分析表明:土壤微生物多样性与土壤性质间存在相关性,尤其以土壤微生物多样性与Emg~(2+)间相关性最为显著。61条代谢通路与土壤交换钙(ECa~(2+))、土壤有机碳(SOC)、土壤总磷(STP)、土壤总钾(TK)、pH以及土壤交换镁(Emg~(2+))相关。Emg~(2+)与包括精氨酸和脯氨酸代谢、丙酮酸代谢在内的31条代谢通路显著正相关。
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| 关 键 词： | 白云岩喀斯特 土壤微生物群落 功能基因预测 代谢通路 |
The diversity analysis of soil microbial community based on the high throughput sequencing under the Dolomite Karst rocky desertification environment |
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| TANG Jing,LI Yuke,HE Xinzhu,TANG Xiaoxin.The diversity analysis of soil microbial community based on the high throughput sequencing under the Dolomite Karst rocky desertification environment[J].Journal of Guizhou Normal University(Natural Sciences),2020,38(5):20-28. |
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| Authors: | TANG Jing LI Yuke HE Xinzhu TANG Xiaoxin |
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