| 苦荞CCT基因家族生物信息学及表达分析 |
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| 引用本文： | 石桃雄,赵佳利,田桃,陈庆富,邓娇.苦荞CCT基因家族生物信息学及表达分析[J].广西科学,2021,28(3):301-309. |
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| 作者姓名： | 石桃雄 赵佳利 田桃 陈庆富 邓娇 |
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| 作者单位： | 贵州师范大学荞麦产业技术研究中心, 贵州贵阳 550001 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31860408）、贵州省科技计划项目（黔科合基础[2020]1Y095）、国家现代农业产业体系荞麦育种岗位科学家专项（CARS-07-A5）和贵州省教育厅荞麦种质资源保育及创新重点实验室建设基金项目（黔教合KY[2017]002）资助。 |
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| 摘 要： | CCT转录因子在调控植物花期、生长发育及抗非生物胁迫等方面发挥着重要的功能。本研究以拟南芥AtCCT基因家族为参考序列,利用本地BLAST并结合保守结构域等生物信息学工具,筛选出苦荞FtCCT基因家族成员,并对其理化性质、染色体分布、基因结构、系统进化及表达水平进行分析。结果显示:从苦荞中共鉴定出35个FtCCT基因,含1-8个内含子;编码蛋白有117-753个氨基酸残基,等电点为4.96-9.51,均为亲水性蛋白。染色体定位分析表明,这些基因在8条染色体上均有分布。苦荞FtCCT基因家族含有10个保守基序和5个保守结构域,且都含有CCT保守结构域。系统进化分析表明,苦荞的FtCCT基因家族与拟南芥一样可分为3个亚家族,其中CMF亚家族的成员最多。35个FtCCT基因在苦荞根、茎、叶和花中的表达水平具有差异性,在叶和花中具有高表达量的成员较多,只有少数的成员在根和茎中高表达。本研究为进一步解析CCT基因调控苦荞花期及生长发育奠定基础。
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| 关 键 词： | 苦荞 开花 FtCCT 系统进化 表达分析 |
| 收稿时间： | 2021/5/15 0:00:00 |
Bioinformatics and Expression Analysis of CCT Gene Family in Fagopyrum tataricum |
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| SHI Taoxiong,ZHAO Jiali,TIAN Tao,CHEN Qingfu,DENG Jiao.Bioinformatics and Expression Analysis of CCT Gene Family in Fagopyrum tataricum[J].Guangxi Sciences,2021,28(3):301-309. |
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| Authors: | SHI Taoxiong ZHAO Jiali TIAN Tao CHEN Qingfu DENG Jiao |
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| Institution: | Research Center of Buckwheat Industry Technology, Guizhou Normal University, Guiyang, Guizhou, 550001, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Fagopyrum tataricum flowering FtCCT phylogenetics expression analysis |
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