| 16S rDNA特异性引物设计优化及其在淞江鲈体表微生物鉴定中的应用 |
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| 引用本文： | 徐鹏昊,罗武松,何恩明,王焱磊,蔡枫,张亮,窦同海,王金秋,周雁.16S rDNA特异性引物设计优化及其在淞江鲈体表微生物鉴定中的应用[J].复旦学报(自然科学版),2018(1). |
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| 作者姓名： | 徐鹏昊 罗武松 何恩明 王焱磊 蔡枫 张亮 窦同海 王金秋 周雁 |
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| 作者单位： | 复旦大学生命科学学院微生物学与微生物工程系;复旦大学生命科学学院遗传学研究所遗传工程国家重点实验室;上海人类基因组研究中心上海市疾病与健康基因组学重点实验室; |
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| 摘 要： | 引物与模板的结合特异性是PCR反应成功与否的主要决定因素之一.在进行以16srDNA为目标序列的菌种鉴定或者各种检测应用中,对引物的特异性具有较普遍的要求.需扩增出完整的目标属,实现属内保守,同时避免有效扩增其他属的相应序列即实现属间特异.对此,我们对引物设计进行优化,通过分析所有已知细菌16srDNA序列,针对特定目标属筛选特异和最高效的引物对,并在淞江鲈的体表菌群样品中进行验证实验.结果表明,所设计的引物具有较好的属内保守性和特异性,而且引物在扩增中的效率也有一定的保证,能够很好地应用于菌群的定量PCR分析.
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