| LEPREL1是特发性肺纤维化的潜在治疗靶点 |
| |
| 引用本文： | 凡志婷,唐宇龙,陈雅慧,孔祥贞,杨婧漪,王久存,姜帅.LEPREL1是特发性肺纤维化的潜在治疗靶点[J].复旦学报(自然科学版),2024(2):257-267+275. |
| |
| 作者姓名： | 凡志婷 唐宇龙 陈雅慧 孔祥贞 杨婧漪 王久存 姜帅 |
| |
| 作者单位： | 1. 复旦大学生命科学学院;2. 上海市浦东医院 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金青年科学基金(82000070)； |
| |
| 摘 要： | 为了寻找特发性肺纤维化(IPF)的潜在治疗靶点，从GEO获取IPF基因芯片数据，用R分析差异表达基因和通路；用STRING和Cytoscape筛选枢纽(HUB)基因；RNA-Seq和单细胞数据验证，肺纤维化小鼠实验验证，筛选具有相关性的基因，分析潜在通路。结果显示：基因芯片数据集GSE10667、GSE53845、GSE48149共116例样本，差异基因132个，主要富集在细胞外基质、胶原等通路。STRING和Cytoscape筛选HUB基因，主要为COL1A1、CXCL12、LEPREL1等基因，其中LEPREL1表达显著下调(GSE10667,Padj=0.000 96; GSE53845,Padj=0.000 104 8; GSE48149,Padj=0.015 17)。LEPREL1在RNA-Seq数据集GSE92592(Padj=0.028 8)、GSE83717(Padj=0.006 268)、GSE150910(Padj=1.952 8e-3...
|
| 关 键 词： | 生物信息学 特发性肺纤维化 LEPREL1 |
|
|
