一种用于蛋白质检索的运用混合谱特征的形状描述符 |
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引用本文: | 彭玉旭,张广平,夏卓群.一种用于蛋白质检索的运用混合谱特征的形状描述符[J].长沙理工大学学报(自然科学版),2019,16(3). |
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作者姓名: | 彭玉旭 张广平 夏卓群 |
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作者单位: | 长沙理工大学 综合交通运输大数据智能处理省重点实验室,湖南 长沙 410114;长沙理工大学 计算机与通信工程学院,湖南 长沙 410114;长沙理工大学 计算机与通信工程学院,湖南 长沙,410114 |
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基金项目: | 湖南省自然科学基金;长沙理工大学青年教师成长计划项目 |
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摘 要: | 蛋白质的不同构像及结构变化使得传统的形状描述算法在蛋白质数据集上的检索效果并不理想。为了提高检索性能,提出了一种新的基于混合谱特征的蛋白质形状描述符及蛋白质检索框架,该方法结合了Wave Kernel Signature和Heat Kernel Signature产生新的Bag of Feature,即WKS_HKS算法。对WKS_HKS算法和现有的几种形状描述算法在三个不同类型的分子数据集上进行了综合比较。实验结果表明,该算法比单一的算法的检索效果更好,并优于几种对比的形状描述算法。
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关 键 词: | 形状描述 波核签名 热核签名 混合谱签名 蛋白质检索 Bag of Feature |
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