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导盲犬和淘汰犬肠道菌群的差异性研究
引用本文:董建一,许尧,胡雨奇,张利龙,龙尚琴,李鹏飞,王靖宇,李明.导盲犬和淘汰犬肠道菌群的差异性研究[J].实验动物科学,2019,36(3):40-47.
作者姓名:董建一  许尧  胡雨奇  张利龙  龙尚琴  李鹏飞  王靖宇  李明
作者单位:大连医科大学实验动物中心;大连医科大学第二临床学院;大连医科大学基础医学院微生态学教研室
基金项目:大学生创新创业训练计划项目(No.2017101610100129)
摘    要:目的 探究导盲犬和淘汰犬之间肠道菌群的差异,分析两者特征性差异菌群。方法 收集16只导盲犬和10只淘汰犬的新鲜粪便样本,按照犬品种和性别分为拉布拉多雄性导盲犬(GD-ML)和淘汰犬(ED-ML)、拉布拉多雌性导盲犬(GD-FL)和淘汰犬(ED-FL)、金毛雄性导盲犬(GD-MG)和淘汰犬(ED-MG),另外从中随机抽取9只导盲犬和4只淘汰犬分为导盲犬组(GD)和淘汰犬组(ED),共分为4组配对。提取粪便样本总DNA,应用PCR-DGGE技术获得肠道菌群图谱,应用相关软件和统计学方法对每组配对进行差异性分析。结果 聚类分析结果显示,GD和ED,GD-ML和ED-ML,GD-FL、ED-FL和GD-MG均各归为一类,表明导盲犬和淘汰犬之间肠道菌群存在差异。肠道菌群多样性、丰富度和均匀度分析结果显示,每两个配对组之间多样性指数、丰富度指数和均匀度指数存在差异,但差异均无统计学意义。差异性条带测序分析结果显示:与ED相比,GD Megamonas funiformis YIT 11815菌株增多;与ED-ML相比,GD-ML Succinatimonas hippei YIT 12066、Lactobacillus vaginalis DSM 5837、Lactobacillus acidophilus NCFM、Faecalibacterium prausnitzii A2-165菌株增多,Collinsella aerofaciens ATCC 25986和Prevotella copri DSM 18205菌株减少;与ED-FL相比,GD-FL Ruminococcus gnavus AGR2154、Fusobacterium russii ATCC 25533菌株减少;与ED-MG相比,GD-MG Tropheryma whipplei str. Twist菌株增多。结论 本研究发现导盲犬和淘汰犬肠道菌群存在差异,未来对差异菌群的进一步研究可能有助于辅助导盲犬的早期筛选。

关 键 词:导盲犬  肠道菌群  PCR-DGGE技术  

Analysis of the Differences of Gut Microbiota between Guide Dogs and Eliminated Dogs
DONG Jianyi,XU Yao,HU Yuqi,ZHANG Lilong,LONG Shangqin,LI Pengfei,WANG Jingyu,LI Ming.Analysis of the Differences of Gut Microbiota between Guide Dogs and Eliminated Dogs[J].Shiyan Dongwu Kexue,2019,36(3):40-47.
Authors:DONG Jianyi  XU Yao  HU Yuqi  ZHANG Lilong  LONG Shangqin  LI Pengfei  WANG Jingyu  LI Ming
Institution:(Laboratory Animal Center of Dalian Medical University,Dalian 116044,China;The Second Hospital of Dalian Medical University,Dalian 116044,China;College of Basic Medical Sciences,Dalian Medical University,Dalian 116044,China)
Abstract:DONG Jianyi;XU Yao;HU Yuqi;ZHANG Lilong;LONG Shangqin;LI Pengfei;WANG Jingyu;LI Ming(Laboratory Animal Center of Dalian Medical University,Dalian 116044,China;The Second Hospital of Dalian Medical University,Dalian 116044,China;College of Basic Medical Sciences,Dalian Medical University,Dalian 116044,China)
Keywords:Guide Dog  gut microbiota  PCR-DGGE technology
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