缺铁诱导的水稻根转录本组和蛋白质组分析与膜泡运输 |
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引用本文: | 印莉萍,孙彤,李伟,黄勤妮,刘祥林.缺铁诱导的水稻根转录本组和蛋白质组分析与膜泡运输[J].自然科学进展,2004,14(5):522-527. |
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作者姓名: | 印莉萍 孙彤 李伟 黄勤妮 刘祥林 |
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作者单位: | 首都师范大学生物系,北京,100037 |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展计划(973计划),国家自然科学基金 |
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摘 要: | 为了解水稻受缺铁胁迫后根细胞整体水平mRNA和蛋白质的变化规律,对缺铁和加铁的水稻根分别进行了转录本组的微点阵分析和翻译水平的蛋白质组双向电泳与基质辅助的激光解析时间飞行质谱(MALDI-TOF)分析.在10531个点的水稻cDNA芯片图谱上,比较缺铁与加铁之间的相对表达水平(REL),发现了451个差异cDNA点,其中在2.0~9.175之间的缺铁诱导上调基因为203个,在0.075~0.49之间缺铁诱导的下调基因为248个.在水稻根可溶性蛋白双向电泳(IEF-SDS-PAGE)结果中,得到多达约1500个点的蛋白质图谱.比较缺铁与EDTA螯合二价铁培养的水稻根可溶性蛋白质图谱,发现了23个差异蛋白质,其中缺铁诱导加强的有4个,减弱的有2个,特异的有7个.从缺铁处理的聚丙烯酰胺凝胶上选取差异蛋白质,用胰蛋白酶进行水解.继而进行了MALDI-TOF检测 ,获得9个蛋白质的肽质量指纹谱的检索数据和分析结果.最后对缺铁诱导的膜泡运输和能量代谢相关的基因做了详尽的分析.
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关 键 词: | 水稻根 缺铁胁迫 微点阵 双向电泳 飞行质谱 膜泡运输 |
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