| 基于转录本组和蛋白质组数据的日本血吸虫候选疫苗分子序列的预测和分析 |
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| 引用本文： | 贾侃, 赵犇鹏, 张艳丽, 邵东华, 冯新港, 林矫矫, 李利珍.基于转录本组和蛋白质组数据的日本血吸虫候选疫苗分子序列的预测和分析[J].上海师范大学学报(自然科学版),2010,39(3):299-308. |
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| 作者姓名： | 贾侃 赵犇鹏 张艳丽 邵东华 冯新港 林矫矫 李利珍 |
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| 作者单位： | 1. 上海师范大学生命与环境科学学院,上海,200234
2. 中国农业科学院上海兽医研究所,上海,200241 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划973课题 |
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| 摘 要： | 预测了可能模拟致弱疫苗免疫保护性效果的日本血吸虫抗原分子,为实验鉴定抗日本血吸虫候选疫苗分子提供基础.实验基于已发表的辐照尾蚴转化的童虫的特征性转录本组(曼氏血吸虫)和蛋白质组(日本血吸虫)序列,用BLASTP算法等搜寻来源于正常日本血吸虫童虫和成虫的转录本组和蛋白质组中的序列;应用在线软件、相关数据库及文献对这些序列进行序列注释分析.结果获得了与辐照尾蚴转化的童虫特征性表达的分子同源或一致的日本血吸虫序列131条,它们较高比例地出现在正常童虫高表达的分子集类中;进一步文献分析预测得到了52个日本血吸虫候选疫苗分子,它们的序列特征与存在于血吸虫体被的一些分子和已知的抗血吸虫疫苗分子的相类似.用数据挖掘技术获得了一批日本血吸虫候选疫苗分子,为进一步实验研究奠定了基础.
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| 关 键 词： | 日本血吸虫 转录本组 蛋白质组 候选疫苗分子 预测 |
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