| 菠菜抗坏血酸过氧化物酶基因家族的鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 郁征宇,葛晨辉,王小丽,徐晨曦,王全华,蔡晓锋.菠菜抗坏血酸过氧化物酶基因家族的鉴定及表达分析[J].上海师范大学学报(自然科学版),2018,47(6):664-672. |
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| 作者姓名： | 郁征宇 葛晨辉 王小丽 徐晨曦 王全华 蔡晓锋 |
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| 作者单位： | 上海师范大学 生命科学学院 植物种质资源开发协同创新中心, 上海 200234,上海师范大学 生命科学学院 植物种质资源开发协同创新中心, 上海 200234,上海师范大学 生命科学学院 植物种质资源开发协同创新中心, 上海 200234,上海师范大学 生命科学学院 植物种质资源开发协同创新中心, 上海 200234,上海师范大学 生命科学学院 植物种质资源开发协同创新中心, 上海 200234,上海师范大学 生命科学学院 植物种质资源开发协同创新中心, 上海 200234 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年基金（31501754），上海市科研创新行动计划（16391901000）；上海植物种质资源工程技术研究中心项目（17DZ2252700）；上海市协同创新中心项目（ZF1205） |
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| 摘 要： | 利用生物信息学分析方法,在菠菜全基因组中鉴定出了菠菜(Spinacia oleracea)抗坏血酸过氧化物酶(APX)家族成员,并对其理化性质、亚细胞定位、基因结构、保守基序、同源关系及基因表达进行了分析,发现菠菜中存在7个SoAPXs(SoAPX1～7)基因,并通过进化树分析将菠菜APX家族分为4类.基因结构分析发现该家族基因由5～9个外显子构成.亚细胞定位预测表明大部分菠菜APX蛋白定位在细胞质.实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)结果表明:SoAPXs在各个组织器官中呈组成型表达,其中SoAPX1和SoAPX3的组织表达模式相似,SoAPX4和SoAPX5相似,SoAPX2在新叶中表达最高,SoAPX7在雄花中表达最高.对经胁迫处理后的样品进行表达分析发现,低温胁迫与氧化胁迫对SoAPXs的表达均有诱导作用,盐胁迫与干旱胁迫也刺激了大部分SoAPXs的表达.这些结果表明:SoAPXs可能在菠菜的抗盐、耐寒、抗旱以及抗氧化过程中起作用,为后续深入鉴定APX家族成员的功能提供参考.
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| 关 键 词： | 菠菜(Spinacia oleracea) 抗坏血酸过氧化物酶(APX) 逆境胁迫 基因表达 实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR) |
| 收稿时间： | 2018/9/13 0:00:00 |
Identification and expression analysis of ascorbate peroxidase gene family in spinach |
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| YU Zhengyu,GE Chenhui,WANG Xiaoli,XU Chenxi,WANG Quanhua and CAI Xiaofeng.Identification and expression analysis of ascorbate peroxidase gene family in spinach[J].Journal of Shanghai Normal University(Natural Sciences),2018,47(6):664-672. |
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| Authors: | YU Zhengyu GE Chenhui WANG Xiaoli XU Chenxi WANG Quanhua and CAI Xiaofeng |
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| Institution: | Development Center of Plant Germplasm Resources, College of Life Sciences, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China,Development Center of Plant Germplasm Resources, College of Life Sciences, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China,Development Center of Plant Germplasm Resources, College of Life Sciences, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China,Development Center of Plant Germplasm Resources, College of Life Sciences, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China,Development Center of Plant Germplasm Resources, College of Life Sciences, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China and Development Center of Plant Germplasm Resources, College of Life Sciences, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | spinach (Spinacia oleracea) ascorbate peroxidase (APX) abiotic stresses gene expression real-time quantitative polymerase chain reaction (qRT-PCR) |
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