HIV-1逆转录酶非核苷类抑制剂MKC分子结合位点的理论研究 |
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引用本文: | 王宁,邓圣荣,金毅,徐四川,何耀莹.HIV-1逆转录酶非核苷类抑制剂MKC分子结合位点的理论研究[J].云南民族大学学报(自然科学版),2009,18(1). |
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作者姓名: | 王宁 邓圣荣 金毅 徐四川 何耀莹 |
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作者单位: | 1. 云南大学,化学科学与工程学院,教育部自然资源药物化学重点实验室,云南,昆明,650091 2. 浙江工商大学,食品与生物工程学院,浙江,杭州,310018 |
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基金项目: | 国家自然科学基金,云南省后备人才科研基金 |
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摘 要: | 1RT1蛋白是一个HIV-1逆转录酶核心蛋白,是抑制剂药物分子的作用靶点.非核苷类抑制剂MKC分子是1RT1蛋白中的配体分子.采用量子力学密度泛函理论,B3LYP计算方法,结合6-31G(d,P)基组,逐个计算MKC分子与其周围半径0.7 nm结构范围内的34个氨基酸残基相互作用和结合能,发现在1RT1蛋白中103Lys残基是MKC分子的结合作用位点,结合能值为-46.73 kJ·mol-1.该结合位点的发现将为进一步设计和寻找抗HIV-1逆转录酶抑制剂药物分子提供一些理论基础.
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关 键 词: | 1RT1蛋白 结合位点 |
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