| 果蝇胚胎不同表达水平基因内含子序列特征的比较分析 |
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| 引用本文： | 陈丹 李慧敏,张静,梁振霞.果蝇胚胎不同表达水平基因内含子序列特征的比较分析[J].云南大学学报(自然科学版),2013,35(2):254-260. |
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| 作者姓名： | 陈丹 李慧敏 张静 梁振霞 |
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| 作者单位： | 1.云南大学 数学与统计学院,云南 昆明 650091;2.云南民族大学 数学与计算机科学学院,云南 昆明 650031 |
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| 基金项目： | 云南省教育厅科学研究基金（2012Y497）;云南大学校级科学研究基金（2012CG016）. |
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| 摘 要： | 对果蝇胚胎低表达和高表达水平基因内含子的序列结构进行分析,发现2种表达水平的基因内含子序列特征有明显差异.高表达基因的内含子一般比低表达基因的长,其中高表达基因第1内含子的平均长度是低表达基因的2.62倍,第2内含子的平均长度是低表达基因的1.79倍.两类基因第1内含子中的CpG岛含量最高,并且高表达基因内含子中CpG岛含量要高于低表达基因.此外,与低表达基因相比,TATA box、CAAT box和GC box在高表达基因内含子中出现的频数明显要高些,尤其是在第1内含子中.作者还提取出果蝇胚胎2种表达水平基因第1内含子中高频出现的6-mer简单重复序列,发现一些重复序列与实验得到的转录因子结合位点相符合.这些结果提示内含子特别是第1内含子有可能调控果蝇胚胎基因的转录从而影响基因的表达水平.
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| 关 键 词： | 果蝇胚胎 基因表达水平 转录调控 内含子 序列特征 |
Comparative analysis of sequence features of introns with different expression genes of Drosophila embryo |
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| CHEN Dan,LI Huimin,ZHANG Jing,LIANG Zhenxia.Comparative analysis of sequence features of introns with different expression genes of Drosophila embryo[J].Journal of Yunnan University(Natural Sciences),2013,35(2):254-260. |
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| Authors: | CHEN Dan LI Huimin ZHANG Jing LIANG Zhenxia |
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| Institution: | 1.School of Mathematics and Statistics,Yunnan University,Kunming 650091,China;2.School of Mathematics and Computer Science,Yunnan University of Nationalities,Kunming 650031,China |
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