| 分子模型对接的平滑积分变换方法 |
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| 引用本文： | 李炜疆,李春华.分子模型对接的平滑积分变换方法[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2000,31(1):12-16. |
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| 作者姓名： | 李炜疆 李春华 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学理论物理与理论生物学研究所 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金!（39760027） |
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| 摘 要： | 提出了三维分子对接模型果上互作用的势能函数采用平 积分变换方法进行全局极小化寻找对拉的最佳结合构型，计算本的算法对接问题效果良好，讨论了势能函数拟合参数选取和极小追踪方法问题。
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| 关 键 词： | 分子对接 平滑积分变换 分子模型 分子生物学 |
Application of the SITM to a Model of Molecular Docking |
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| LI Wei jiang,LI Chun hua.Application of the SITM to a Model of Molecular Docking[J].Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Neimongol,2000,31(1):12-16. |
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| Authors: | LI Wei jiang LI Chun hua |
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| Abstract: | A 3 dimensional model of molecular docking is proposed. We minimize inter molecule interaction potential functions by applying the smoothing integral transformation method (SITM) in order to find the optimal configuration(i.e., the absolute potential energy minimizer) of the docking molecules. The results show that the SITM is a pretty efficient method for the problem of molecular docking. In addition, the problems on the choice of the fitting parameters of the potential function and the minimum tracing method are discussed. |
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| Keywords: | molecular docking smoothing integral transformation method global optimization |
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