| 基于离散增量和协变判别函数识别蛋白质亚核定位 |
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| 引用本文： | 李凤敏,李前忠,林昊.基于离散增量和协变判别函数识别蛋白质亚核定位[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2008,39(1):56-60. |
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| 作者姓名： | 李凤敏 李前忠 林昊 |
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| 作者单位： | 1. 内蒙古大学理工学院物理系,呼和浩特,010021;内蒙古农业大学理学院,呼和浩特,010018
2. 内蒙古大学理工学院物理系,呼和浩特,010021 |
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| 摘 要： | 利用离散增量结合协变判别函数,选取氨基酸组份和N端氨基酸二肽组份为信息参数,对蛋白质亚核定位进行预测.在序列相似性小于等于25%时,406个单定位亚核蛋白Jackknife检验总预测成功率为75.9%,相关系数CC为0.644,把多定位亚核蛋白作为独立测试集,92个多定位亚核蛋白总预测成功率为78.3%.在序列相似性小于等于65%时,504个单定位亚核蛋白Jackknife检验总预测成功率为75.6%,相关系数CC为0.643,92个多定位亚核蛋白总预测成功率为80.4%.与 Lei等人利用Lei-SVM方法对该数据库预测结果相比,单定位亚核蛋白总预测成功率比Lei等人高9.1%,CC值比Lei等人高0.124,多定位亚核蛋白总预测成功率比Lei等人高15.2%.
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| 关 键 词： | 离散增量 协变判别函数 亚核蛋白 Jackknife检验 |
| 文章编号： | 1000-1638（2008）01-0056-05 |
| 收稿时间： | 2007-08-13 |
| 修稿时间： | 2007年8月13日 |
Identifing Subnuclear Localization by Using the Increment of Diversity Combined with the Covariant Discriminant Function |
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| LI Feng-min,LI Qian-zhong,LIN Hao.Identifing Subnuclear Localization by Using the Increment of Diversity Combined with the Covariant Discriminant Function[J].Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Neimongol,2008,39(1):56-60. |
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| Authors: | LI Feng-min LI Qian-zhong LIN Hao |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | increment of diversity covariant discriminant function subnuclear localization Jackknife test |
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