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锌指结构域序列的进化生成模拟——遗传算法在蛋白质结构研究中的应用
引用本文:孙之荣,韩浩.锌指结构域序列的进化生成模拟——遗传算法在蛋白质结构研究中的应用[J].科学通报,1997(17).
作者姓名:孙之荣  韩浩
作者单位:清华大学生物科学与技术系,生物膜与膜工程国家重点实验室,清华大学生物科学与技术系,生物膜与膜工程国家重点实验室 北京 100084,北京 100084
摘    要:遗传算法(Genetic algorithms, GA)是具有高频率的搜索机制的算法.遗传算法不仅为蛋白质结构研究提供了一种全局自适应搜索算法,使能量最低状态(按热力学假说,蛋白质的天然状态的能量最低)的搜索更加方便,而且为我们提供了一种新的想法和研究思路.通过应用遗传算法对锌指结构域序列进行进化模拟,成功地从随机产生的氨基酸序列中,进化生成了一些潜在的锌指结构域序列,不仅在一定意义上证明了氨基酸序列起源的随机性,而且对遗传算法在大规模解空间的搜索能力进行了测试.

关 键 词:遗传算法  锌指结构域  进化模拟  蛋白质序列
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