| 边界元法与广义Langevin动力学相结合的模拟方法 |
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| 引用本文： | 卢本卓,陈慰祖,王存新.边界元法与广义Langevin动力学相结合的模拟方法[J].科学通报,2000,45(14):1482-1486. |
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| 作者姓名： | 卢本卓 陈慰祖 王存新 |
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| 作者单位： | 1. 北京工业大学生物医学工程中心,北京,100022;中国科学技术大学天文与应用物理系,合肥,230026
2. 北京工业大学生物医学工程中心,北京,100022 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金!（批准号： 19774501），国家自然科学基金!29992590－2，北京市自然科学基金!（批准号： 59 |
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| 摘 要： | 提出了将水化力加到广义Ｌａｎｇｅｖｉｎ方程中的新的模拟方法（ＧＬＤＢＥＭ）。水化力通过边界元方法（ＢＥＭ）求出，包括溶质分子与表面诱导电荷的Ｃｏｕｌｏｍｂ相互作用和溶剂对分子表面的压力，摩擦记忆函数采用指数模型。以环苞霉素Ａ（ＣＰＡ）为研究对象，并将ＧＬＤＢＥＭ模拟结果与分子动力学（ＭＤ）模拟和通常的随机动力学（ＳＤ）模拟结果作了比较。结果表明ＧＬＤＢＥＭ模拟方法对研究分子的结构和动力学性质均比Ｓ
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| 关 键 词： | 边界元法 模拟 广义Langevin动力学 生物大分子 |
| 收稿时间： | 2000-01-28 |
| 修稿时间： | 2000-04-30 |
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