基于功能性标记和测序发掘携带有S5n基因的水稻新种质 |
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引用本文: | 杨有新,吴锦文,陈志雄,王兰,郭海滨,李金泉,刘向东,卢永根.基于功能性标记和测序发掘携带有S5n基因的水稻新种质[J].科学通报,2009,54(15):2212-2218. |
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作者姓名: | 杨有新 吴锦文 陈志雄 王兰 郭海滨 李金泉 刘向东 卢永根 |
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作者单位: | 华南农业大学广东省植物分子育种重点实验室, 广州 510642 |
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基金项目: | 国家自然科学基金委员会-广东省人民政府联合基金重点资助项目(批准号: U0631003) |
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摘 要: | 水稻籼粳亚种间杂种具有强大的生物学优势, 但杂种F1普遍高度不育, 难以直接利用. S5n基因可以克服由S5基因座位互作引起的杂种不育性. 目前S5n基因已被成功克隆, 该基因功能区存在大片段的缺失DNA, 为快速并准确发掘携带有S5n的水稻新种质提供基础. 本文将S5n基因序列与日本晴相对应序列进行比对, 在S5n基因缺失DNA的两端设计引物, 对已知携带有S5n和不携带有S5n基因(但携带有S5i或S5j)的水稻材料进行PCR扩增检测, 建立S5n基因的功能性标记. 利用该标记对我国水稻微核心种质进行检测, 其中有10个品种的S5座位中存在DNA片段缺失, 这些品种可能携带有S5n基因. 这些品种包括毫补卡、小红谷、老造谷、三磅七十箩、木邦谷、魔王谷内杂、饭毫皮、飞蛾糯2、包协-7B和特青选恢等, 其中除三磅七十箩和老造谷外, 其余的8个品种均未见报道携带有S5n基因. 对存在缺失DNA的10个品种的扩增片段进行测序, 发现全部品种S5座位的缺失DNA片段都与02428和零轮(已知携带有S5n)的一致, 说明这10个品种S5座位的基因也是没有功能的, 证明确实存在S5n基因.
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关 键 词: | 水稻S5n基因 广亲和品种 微核心种质 功能性标记 |
收稿时间: | 2009-02-10 |
修稿时间: | 2009-04-10 |
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