大规模蛋白质相互作用数据的分析与应用 |
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引用本文: | 孙景春,徐晋麟,李亦学,石铁流.大规模蛋白质相互作用数据的分析与应用[J].科学通报,2005,50(19):2055-2060. |
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作者姓名: | 孙景春 徐晋麟 李亦学 石铁流 |
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作者单位: | 1. 上海交通大学生命科学技术学院,上海,200240 2. 中国科学院上海生命科学院生命信息中心生物信息中心,上海,200031 |
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基金项目: | 本工作为国家自然科学基金(批准号:90408010),国家高技术研究发展计划(批准号:2001AA231011,2002AA231051,2003AA231011和2004BA711A21)和国家重点基础研究发展规划(批准号:2002CB713807,2003CB715901和2004CB518606)资助项目. |
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摘 要: | 蛋白质相互作用在生命活动中起着重要的作用. 目前已开发出几种实验和计算方法能够得到大规模蛋白质相互作用数据. 但是, 与传统的实验结果相比, 蛋白质相互作用大规模数据中存在着比例较高的假阳性. 为了能够充分利用这些数据, 需要建立生物信息学方法对这些数据进行系统的评价, 进而提高数据的可信度, 并从中挖掘出有价值的生物信息. 本文对目前蛋白质相互作用大规模数据的计算分析和应用进行了总结, 包括蛋白质相互作用数据评估方法、与蛋白质其他信息的关系以及在生物学研究中的应用, 并提出了开发分析和挖掘蛋白质相互作用数据工具的主要方向, 以期有助于这些数据的研究和应用.
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关 键 词: | 蛋白质相互作用 生物信息学 蛋白质组 蛋白质功能预测 生物途径 |
收稿时间: | 2005-03-05 |
修稿时间: | 2005-03-052005-07-18 |
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