| 一种改进的研究蛋白质-蛋白质相互作用的平均势方法 |
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| 引用本文： | 苏煜,李文飞,张建,王骏,王炜.一种改进的研究蛋白质-蛋白质相互作用的平均势方法[J].科学通报,2007,52(21):2487-2493. |
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| 作者姓名： | 苏煜 李文飞 张建 王骏 王炜 |
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| 作者单位： | 南京大学固体微结构物理国家重点实验室,南京大学物理系,南京,210093 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（批准号：90403120,10474041,10504012）资助项目 |
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| 摘 要： | 在原子水平上发展了一种距离相关的用于研究蛋白质-蛋白质相互作用的平均势(potential of mean force, 简称PMF)方法. 与传统理论模型相比, 我们的模型考虑了蛋白质系统的复杂环境因素. 这种改进使得该模型能够给出物理上更合理和准确的势函数形式. 得到这样的势函数是正确描述蛋白质结构及相互作用的前提条件. 而且借助于改进后的方法, 还可以对蛋白质中残基相互作用的空间拓扑规律进行研究. 期望这种改进将促进平均势方法在蛋白质科学其他领域, 如蛋白质折叠识别, 结构预测及热稳定性预测中的应用和发展.
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| 关 键 词： | 基于知识的方法 平均势(PMF) 蛋白质-蛋白质相互作用 |
| 收稿时间： | 2007-05-28 |
| 修稿时间： | 2007-05-28 |
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