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| 扬子鳄的线粒体全基因组与鳄类系统发生 | |
| 引用本文： | 吴孝兵,王义权,周开亚,朱伟铨,聂继山,王朝林.扬子鳄的线粒体全基因组与鳄类系统发生[J].科学通报,2003,48(18):1954-1958. |
| 作者姓名： | 吴孝兵 王义权 周开亚 朱伟铨 聂继山 王朝林 |
| 作者单位： | 1. 南京师范大学生命科学学院,南京,210097;安徽师范大学生命科学学院,芜湖,241000 2. 南京师范大学生命科学学院,南京,210097;厦门大学生命科学学院,厦门,361005 3. 南京师范大学生命科学学院,南京,210097 4. 安徽省扬子鳄繁殖研究中心,宣州,242034 |
| 基金项目： | 本工作为教育部骨干教师资助计划(批准号: GG-180-21002403-1740)和教育部留学回国人员启动基金资助项目. |
| 摘 要： | 通过酶切、克隆、测序, 结合Long-PCR和Primer Walking法对扬子鳄线粒体DNA基因组进行全序列测定. 结果表明, 扬子鳄线粒体基因组DNA序列全长为16746 bp, 其基因组碱基组成为29.43%A, 24.59%T, 14.86%G, 31.12%C. 与其他大多数脊椎动物相同, 其基因组由13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因及1个非编码的控制区(D-loop)组成. 基因的排列与已测序的鳄类相似. 在全序列分析的基础上, 对12S rRNA基因序列、16S rRNA基因序列、蛋白质编码基因序列及其合并数据用MP法和ML法构建系统发生树, 结果表明扬子鳄与密河鳄的亲缘关系较近, 支持传统观点. 根据ML树的支长数值估计钝吻鳄属发生的时间为74.9 MaBP, 扬子鳄与密河鳄分歧的时间为50.9 MaBP. |
| 关 键 词： | 扬子鳄 线粒体基因组 全序列 系统发生 分歧时间 |
| 收稿时间： | 2003-05-05 |
| 修稿时间： | 2003年5月5日 |
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