牦牛GSTK1基因序列特征分析及其组织表达谱构建 |
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作者姓名: | 潘帮婷 熊显荣 于海玲 杨满珍 胡宇磊 朱艳锦 费熙熙 李键 |
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作者单位: | 1. 西南民族大学畜牧兽医学院;2. 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室;3. 动物科学国家民委重点实验室 |
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基金项目: | 中央高校基本科研业务费专项资助项目(2022NYXXS039); |
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摘 要: | 旨在探讨谷胱甘肽硫转移酶K1(Glutathione S-Transferase Kappa1,GSTK1)基因序列特征.以牦牛为试验对象,通过RT-PCR技术扩增GSTK1基因序列并分析生物信息学,采用RT-qPCR技术构建其在牦牛不同组织中的表达谱.ORF分析显示,牦牛GSTK1基因编码区为618 bp,编码氨基酸为205个.系统发育树分析显示,牦牛与野牦牛(99.68%)、黄牛(99.68%)和野牛(99.40%)之间的同源性最高,与北极熊(87.63%)、野猪(87.25%)和马(87.01%)之间的同源性最低.蛋白预测分析显示,GSTK1蛋白为不稳定的亲水蛋白,存在12个磷酸化位点.高级结构预测分析显示,GSTK1蛋白的主要成分为α-螺旋(50.73%)、无规卷曲(40.00%)和延伸链(9.27%).组织表达分析发现GSTK1在所检测牦牛卵巢、小肠、脾、肝、肾、肌肉、肺和心组织中均有表达,其中表达量最高的组织是肝,表达量最低的组织是脾和心,且与其他组织差异显著(P<0.05).本研究获得了牦牛GSTK1基因的序列特征及组织表达谱,为进一步挖掘牦牛GSTK1基因的功能提...
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关 键 词: | 牦牛 GSTK1基因 序列特征 生物信息学 组织表达谱 |
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