人类基因组中L1元件及其5'UTR的研究 |
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引用本文: | 陈伟,罗辽复,张利绒.人类基因组中L1元件及其5'UTR的研究[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2007,38(4):403-412. |
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作者姓名: | 陈伟 罗辽复 张利绒 |
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作者单位: | 内蒙古大学理工学院物理系,呼和浩特010021 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(90403010,10447003) |
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摘 要: | 讨论了L1在人类染色体中的分布密度与染色体长度以及L1的密度与基因密度之间的关系.发现在大多数染色体上L1的密度和染色体的长度表现为正相关,而L1的密度和染色体中基因的密度表现为负相关;对人类L1的5’UTR进行了详细的研究后,发现在L1元件的5’UTR部分含有许多转录因子结合位点.对基因的转录起始位点上游进行统计分析,发现其中含有大量的L1序列.通过对人类的EST数据库进行BLAST分析,新发现了51条和人类L15’UTR相似性较高的EST片断,根据它们分布的组织特异性,说明L1元件可能调控与发育过程有关的基因的表达;最后应用多样性增量的方法对人类和大鼠的L1 5'UTR进行了区分,得到了较好的预测结果,说明大部分L1的5’UTR的调控作用是人类特有的.
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关 键 词: | L1 线性关系 转录因子结合模体 调控 |
文章编号: | 1000-1638(2007)04-0403-10 |
修稿时间: | 2007-01-26 |
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