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分子动力学模拟探索乳克鲁维酵母来源的β-半乳糖苷酶热变性条件
作者姓名:曹锟  王若男  熊兴东  吴赟  刘新光
作者单位:1.广东医科大学广东省医学分子诊断重点实验室/衰老研究所/生物化学与分子生物学研究所,东莞 523808
基金项目:广东医科大学学科建设项目;广东医科大学博士学位人员科研启动基金项目;广东医科大学科研基金自然科学类面上培育项目;国家自然科学基金;广东省医学科学技术研究基金项目;广东省基础与应用基础研究基金项目
摘    要:为了研究乳克鲁维酵母中β-半乳糖苷酶可能的熔解温度,采用分子动力学模拟的方法,分别对4种不同温度条件下(35、50、65、80 ℃)的β-半乳糖苷酶进行了50 ns的计算模拟,分析了酶的构象变化以及酶活性中心的差异。研究在原子水平揭示了β-半乳糖苷酶的温度耐受等关键信息:35 ℃为最适酶活温度,该温度下的β-半乳糖苷酶的整体构象最稳定;该酶在50 ℃时的原子波动性显著增加,表明此温度可能趋近熔解温度临界值;蛋白在大于65 ℃条件下丧失柔性,说明蛋白已经变性;进一步的构象分析发现80 ℃高温会破坏β-D-半乳吡喃糖(GAL)结合位点微环境。

关 键 词:分子动力学模拟   β-半乳糖苷酶   温度   稳定性
收稿时间:2021-06-22
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