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人类核糖体蛋白加工假基因在进化中的熵变
引用本文:刘国庆,李宏,王芳平,应智强. 人类核糖体蛋白加工假基因在进化中的熵变[J]. 内蒙古大学学报(自然科学版), 2007, 38(6): 647-653
作者姓名:刘国庆  李宏  王芳平  应智强
作者单位:内蒙古大学理工学院物理系,呼和浩特,010021;内蒙古大学理工学院物理系,呼和浩特,010021;内蒙古大学理工学院物理系,呼和浩特,010021;内蒙古大学理工学院物理系,呼和浩特,010021
基金项目:国家自然科学基金 , 教育部高等学校博士学科点专项科研基金
摘    要:用生物信息学方法计算出人类核糖体蛋白加工假基因(RP加工假基因)的进化距离.假定在统计意义上,不同进化距离的假基因可粗略代表假基因的进化历程.在此假定基础上从信息论的角度去研究假基因在进化中的熵变.结果发现,1) 假基因序列的紧邻碱基关联随进化逐步增强;2) k-mer信息熵中,小k-mer(k=1,2,…,5)信息熵随进化减少,大k-mer(k=7,8)信息熵随进化先迅速减少,随后增加;3) 关联信息熵随进化减少,其中紧邻碱基关联信息熵的减少幅度最明显.这些可能与背景突变压力作用有关.

关 键 词:加工假基因  紧邻碱基关联  k-mer信息熵  关联信息熵  背景突变压力
文章编号:1000-1638(2007)06-0647-07
收稿时间:2007-03-27
修稿时间:2007-03-27

Entropy Variation of the Human Ribosomal Protein Processed Pseudogenes During Evolution
LIU Guo-qing,LI Hong,WANG Fang-ping,YING Zhi-qiang. Entropy Variation of the Human Ribosomal Protein Processed Pseudogenes During Evolution[J]. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Neimongol, 2007, 38(6): 647-653
Authors:LIU Guo-qing  LI Hong  WANG Fang-ping  YING Zhi-qiang
Abstract:
Keywords:processed pseudogene   adjacent base correlation   k-mer information entropy   correlation information entropy  background mutational pressure
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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