| 利用最小二乘法判断同位素标记肽的假阳性 |
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| 引用本文： | 宋培明,张扬,颜志国,骆建华,刘银坤,杨芃原,陈先. 利用最小二乘法判断同位素标记肽的假阳性[J]. 上海交通大学学报, 2009, 43(1) |
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| 作者姓名： | 宋培明 张扬 颜志国 骆建华 刘银坤 杨芃原 陈先 |
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| 作者单位： | 宋培明,SONG Pei-ming(上海交通大学,生命科学技术学院,上海,200240;复旦大学,生物医学研究院,上海,200032);张扬,刘银坤,杨芃原,陈先,ZHANG Yang,LIU Yin-kun,YANG Peng-yuan,CHEN Xian(复旦大学,生物医学研究院,上海,200032);颜志国,骆建华,YAN Zhi-guo,LUO Jian-hua(上海交通大学,生命科学技术学院,上海,200240) |
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| 基金项目： | 上海市科委国际合作项目，国家()科技攻关项目，国家自然科学基金，国家高技术研究发展计划(863计划) |
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| 摘 要： | 提出了1种判别标记肽假阳性的方法,根据同位素分布的概率原理计算出不同标记效率下的理论同位素分布,利用最小二乘法拟合得到标记肽的标记效率,根据标记肽的假阳性阈值来判断标记肽的假阳性,并使用本方法判断了比较蛋白质组试验中的3个标记肽,结果表明,在这3个标记肽中有2个阳性标记肽结果,1个假阳性标记肽,说明此方法简单可靠,可用于判定标记肽的假阳性,衡量标记肽和正常肽之间的相似性,判断质谱峰型的变化,排除标记肽假阳性对蛋白质定量的影响.
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| 关 键 词： | 最小二乘法 同位素分布 比较蛋白质组 氨基酸同位素标记定量 |
Evaluation on False-Positive of Isotope-Labeled Peptides Using Least-Square Method |
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| SONG Pei-ming,ZHANG Yang,YAN Zhi-guo,LUO Jian-hua,LIU Yin-kun,YANG Peng-yuan,CHEN Xian. Evaluation on False-Positive of Isotope-Labeled Peptides Using Least-Square Method[J]. Journal of Shanghai Jiaotong University, 2009, 43(1) |
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| Authors: | SONG Pei-ming ZHANG Yang YAN Zhi-guo LUO Jian-hua LIU Yin-kun YANG Peng-yuan CHEN Xian |
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