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神经网络预测蛋白质二级结构的编码技术
引用本文:李小妹,王能超.神经网络预测蛋白质二级结构的编码技术[J].华中科技大学学报(自然科学版),2004,32(5):61-63.
作者姓名:李小妹  王能超
作者单位:华中科技大学,计算机科学与技术学院,湖北,武汉,430074;华中科技大学,计算机科学与技术学院,湖北,武汉,430074
基金项目:国家自然科学基金资助项目 ( 70 2 71 0 69)
摘    要:考虑不同残基的物理化学性质,将其融入蛋白质二级结构的神经网络预测中,提出了一种新的归一化二进制编码技术,将各种残基不同的疏水值与体积大小归一化结果作为神经网络的二进制输入序列.与其他蛋白质二级结构预测的方法进行了比较,结果表明,该方法能充分利用蛋白质的一级结构信息,获得了很好的预测效果。

关 键 词:神经网络  蛋白质二级结构  结构预测  编码技术
文章编号:1671-4512(2004)05-0061-03
修稿时间:2003年9月16日

Encoding of protein secondary structure prediction in neural network
Li Xiaomei Wang NengchaoLi Xiaomei Assistant engineer, College of Computer Sci. & Tech.,Huazhong Univ. of Sci. & Tech.,Wuhan ,China..Encoding of protein secondary structure prediction in neural network[J].JOURNAL OF HUAZHONG UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY.NATURE SCIENCE,2004,32(5):61-63.
Authors:Li Xiaomei Wang NengchaoLi Xiaomei Assistant engineer  College of Computer Sci & Tech  Huazhong Univ of Sci & Tech  Wuhan  China
Institution:Li Xiaomei Wang NengchaoLi Xiaomei Assistant engineer, College of Computer Sci. & Tech.,Huazhong Univ. of Sci. & Tech.,Wuhan 430074,China.
Abstract:Based on orthogonal encoding mode in protein secondary structure prediction of neural network, a kind of encoding technology including a set of protein physical-chemical features was presented. Compared with other encoding methods, the method has better results using protein primary structure information.
Keywords:neural network  protein secondary structure  structure prediction  encoding technology
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