美姑脊蛇Achalinus meiguensis线粒体基因组全序列及系统发育地位研究 |
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引用本文: | 王广力,何舜平,黄松,何苗,赵尔宓.美姑脊蛇Achalinus meiguensis线粒体基因组全序列及系统发育地位研究[J].科学通报,2009,54(9):1250-1261. |
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作者姓名: | 王广力 何舜平 黄松 何苗 赵尔宓 |
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作者单位: | ① 四川大学生命科学学院, 成都 610064;
② 中国科学院水生生物研究所, 武汉 430072;
③ 黄山学院生命与环境科学学院, 黄山 245041;
④ 中国科学院成都生物研究所, 成都 610041 |
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摘 要: | 报道了美姑脊蛇Achalinus meiguensis线粒体基因组全序列. 美姑脊蛇线粒体全序列长17239 bp, 由22个tRNA, 2个rRNA和13个蛋白质基因及2个非编码的控制区或D-loop组成, 存在着基因重排现象. 对已报道蛇类线粒体基因组全序列进行比对分析后, 发现一些蛇类线粒体基因组进化规律: 双控制区现象在爬行动物进化历史中独立地发生, 有不同的演化历史; tRNA假基因是在真蛇下目(Caenophidia)中进化形成的; TΨC臂的相对较短(一般少于5 bp)和缺失“DHU”臂造成蛇类tRNA较短. 通过MP和BI分析确定美姑脊蛇系统发育位置应该位于瘰鳞蛇Acrochordus granulatus和其他真蛇下目蛇类之间, 而不应该属于游蛇科Colubridae或者眼镜蛇科Elapidae. 由于美姑脊蛇与真蛇下目中蝰科Viperidae、游蛇科以及眼镜蛇科之间的单系性都被统计检验拒绝(P < 0.01), 由此认为美姑脊蛇所在的闪皮蛇亚科(Subfamily, Xenodermatinae)应该提升到科或者更高的分类阶元. 依据系统发育统计检验结果, 我们选择Bayesian树来进行分歧时间的估算. 原蛇下目与真蛇下目的分化时间为109.50 Mya; 而瘰鳞蛇与其他真蛇下目种类的分化时间为106.18 Mya; 美姑脊蛇的分化时间在103 Mya; 蝰科与眼镜蛇科和游蛇科构成的单系群的分化时间发生在96.06 Mya.
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关 键 词: | 美姑脊蛇 线粒体全序列 系统发育 分化时间 |
收稿时间: | 2008-10-21 |
修稿时间: | 2009-03-13 |
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