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鞘氨醇单胞菌中威兰胶合成关键基因welE和welC的生物信息学分析
引用本文:钱锦,李丽,常爱平,陆钰佳,何侨妹,沈亚领,朱虎.鞘氨醇单胞菌中威兰胶合成关键基因welE和welC的生物信息学分析[J].河南师范大学学报(自然科学版),2020,48(1):82-89.
作者姓名:钱锦  李丽  常爱平  陆钰佳  何侨妹  沈亚领  朱虎
作者单位:华东理工大学生物工程学院,上海200237,福建师范大学工业生物催化福建省高校工程研究中心;福建省先进材料化工基础重点实验室;化学与材料学院,福州350007,福建师范大学工业生物催化福建省高校工程研究中心;福建省先进材料化工基础重点实验室;化学与材料学院,福州350007,福建师范大学工业生物催化福建省高校工程研究中心;福建省先进材料化工基础重点实验室;化学与材料学院,福州350007,福建师范大学工业生物催化福建省高校工程研究中心;福建省先进材料化工基础重点实验室;化学与材料学院,福州350007,华东理工大学生物工程学院,上海200237,福建师范大学工业生物催化福建省高校工程研究中心;福建省先进材料化工基础重点实验室;化学与材料学院,福州350007
基金项目:国家自然科学基金;国家高技术研究发展计划(863计划);福建省自然科学基金
摘    要:为探究威兰胶合成途径中关键基因welE和welC的结构特性及功能,运用生物信息学手段分析了welE和welC基因的序列信息,预测了其编码蛋白的理化性质、跨膜区、信号肽、磷酸化修饰、结构域及高级结构等.研究结果表明,WelE蛋白是由234个氨基酸组成的稳定亲水性蛋白质,无跨膜结构和信号肽,存在20个磷酸化位点,含有一个BY-kinase结构域,说明WelE可能参与威兰胶的生产与转运,WelE二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,三级结构呈"圆环状";WelC蛋白是由449个氨基酸组成的不稳定亲水性跨膜蛋白质,含有2个跨膜螺旋、无信号肽,存在39个磷酸化位点,含有一个Wzz结构域,这表明WelC可能与威兰胶链长调节有关,WelC二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,三级结构呈"条状",这些结果为解析welE和welC基因的功能以及建立威兰胶代谢调控方法奠定了理论基础.

关 键 词:威兰胶  welE基因  welC基因  生物信息学  蛋白结构

Bioinformatics analysis of key genes welE and welC involved in welan gum biosynthesis in Sphingomonas sp.WG
Qian Jin,Li Li,Chang Aiping,Lu Yujia,He Qiaomei,Shen Yaling,Zhu Hu.Bioinformatics analysis of key genes welE and welC involved in welan gum biosynthesis in Sphingomonas sp.WG[J].Journal of Henan Normal University(Natural Science),2020,48(1):82-89.
Authors:Qian Jin  Li Li  Chang Aiping  Lu Yujia  He Qiaomei  Shen Yaling  Zhu Hu
Abstract:
Keywords:
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