| Curcin和curcin C与腺嘌呤互作位点的比较分析 |
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| 作者姓名： | 吴朋 邓聿杉 陈放 徐莺 |
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| 作者单位： | 四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610065;四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610065;四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610065;四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610065 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（31870315） |
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| 摘 要： | 麻疯树核糖体失活蛋白curcin和curcin C均具有抗肿瘤活性,但后者的活性水平显著高于前者,为了探索造成这一差异的结构基础,本文采用在线的同源建模预测软件SWISSMODEL,对两种麻疯树核糖体失活蛋白curcin、curcin C的三维结构模型进行预测,采用SYBYL对预测模型进行能量最小化优化,采用PROCHECK、VERIFY 3D和ERRAT软件对优化前后的模型进行质量评估,随后采用AutoDock软件将预测的模型与腺嘌呤进行分子对接分析.结果显示,两种蛋白采用与Ricin A类似的方式与腺嘌呤相互作用,但在相互作用的氨基酸残基种类、数量以及形成的氢键和疏水相互作用上还是存在差异,其中,curcin C与腺嘌呤具有最强的结合能力,curcin则最低.
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| 关 键 词： | 麻疯树 核糖体失活蛋白 结构预测 分子对接 腺嘌呤 |
| 收稿时间： | 2020-03-09 |
| 修稿时间： | 2020-04-24 |
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