反硝化细菌Y39-6的基因组及生理生化特征研究 |
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引用本文: | 韩国秀,张多英,张彦龙,张军,曾伟民,赵丹丹,雷虹.反硝化细菌Y39-6的基因组及生理生化特征研究[J].黑龙江大学自然科学学报,2023(3):300-308. |
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作者姓名: | 韩国秀 张多英 张彦龙 张军 曾伟民 赵丹丹 雷虹 |
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作者单位: | 1. 黑龙江大学农业微生物技术教育部工程研究中心;2. 黑龙江大学生命科学学院黑龙江省普通高校微生物重点实验室;3. 黑龙江大学建筑工程学院;4. 黑龙江大学生命科学学院黑龙江省普通高校分子生物学重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(51608149);;黑龙江省自然科学基金(LH2019E074); |
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摘 要: | 菌株Y39-6是从哈尔滨周边地区地下水中分离的一株假单胞菌,具有异养反硝化和自养脱氮能力,由于假单胞菌属内的菌种鉴定存在复杂性,对菌株Y39-6的具体分类仍有争议。通过获得菌株Y39-6的全基因组序列,进行比较基因组学分析,分析了菌株的碳源利用和脂肪酸含量特征,对菌株的生理生化特征进行了系统研究。发现菌株Y39-6与模式菌Pseudomonas veronii CIP 104663T的基因组相似性更高,G+C的含量接近,共有基因数量最多,为368个,碳源利用特征相似,可以确定菌株Y39-6属于Pseudomonas veronii菌种。菌株Y39-6有15个特有基因,主要脂肪酸为C16∶0和C17∶0 cyclo,含量分别为22.05%和21.25%,与Pseudomonas veronii菌种的其他菌株相比,存在明显的特异性。通过以上研究,确定了菌株Y39-6的分类地位和生物学特征,为菌株Y39-6的进一步应用提供了生物学参考依据。
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关 键 词: | 反硝化细菌 假单胞菌 基因组 比较基因组 脂肪酸 |
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