| 高灵敏度巢式PCR方法扩增HBV全长基因组 |
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| 引用本文： | 张天英,陈清瑞,杨炳春,陈仕海,袁权,葛胜祥.高灵敏度巢式PCR方法扩增HBV全长基因组[J].厦门大学学报(自然科学版),2011,50(5):947-950. |
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| 作者姓名： | 张天英 陈清瑞 杨炳春 陈仕海 袁权 葛胜祥 |
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| 作者单位： | 厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心,福建厦门,361005 |
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| 基金项目： | 福建省自然科学杰出青年基金项目(2009J06020) |
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| 摘 要： | 探讨一种用于乙型肝炎病毒(HBV)基因组扩增的灵敏度高、广谱性好的巢式聚合酶链式反应(nested PCR)方法,适用于较低病毒拷贝数标本的HBV DNA扩增.通过设计两套通用巢式引物,实现对各基因型(A,B,C,D,E,G)HBV均具有较高的扩增效率;采用两步法分段扩增HBV基因组,对两段目的产物进行测序拼接获得HBV的全基因序列.应用本方法对4组病毒拷贝量(IU/mL)分别为:>1.0×104,1.0×103~1.0×104,2.0×102~1.0×103,<2.0×102的100份血清标本进行全长基因组扩增,其中75份获得阳性结果,各组阳性率依次为:100%,66.7%,60%,25%,有效扩增灵敏度为2.0×102~1.0×103IU/mL;而一步法只在病毒拷贝量>1.0×104IU/mL的标本组中获得15份阳性结果,总的阳性率仅为15%,说明该方法扩增灵敏度明显高于一步法.因此,本方法为HBV流行病学调查研究HBV基因组序列提供了更高的灵敏度,可在流行病学调查中发挥重要作用.
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| 关 键 词： | 乙型肝炎病毒 基因组 巢式聚合酶链式反应 |
Amplification of Complete Hepatitis B Virus Genome by a Sensitive Nested PCR |
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| ZHANG Tian-ying,CHEN Qing-rui,YANG Bing-chun,CHEN Shi-hai,YUAN Quan,GE Sheng-xiang.Amplification of Complete Hepatitis B Virus Genome by a Sensitive Nested PCR[J].Journal of Xiamen University(Natural Science),2011,50(5):947-950. |
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| Authors: | ZHANG Tian-ying CHEN Qing-rui YANG Bing-chun CHEN Shi-hai YUAN Quan GE Sheng-xiang |
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| Institution: | ZHANG Tian-ying,CHEN Qing-rui,YANG Bing-chun,CHEN Shi-hai,YUAN Quan,GE Sheng-xiang(National Institute of Diagnostics and Vaccine Development in Infectious Diseases,Xiamen University,Xiamen 361005,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | hepatitis B virus genome nested PCR |
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