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应用生物信息学鉴定急性STEMI患者通路及Hub基因
引用本文:刘铮,王治财,仓彦,钱云云,刘静,尹依恒. 应用生物信息学鉴定急性STEMI患者通路及Hub基因[J]. 安徽理工大学学报(自然科学版), 2022, 42(1): 93-98. DOI: 10.3969/j.issn.1672-1098.2022.01.015
作者姓名:刘铮  王治财  仓彦  钱云云  刘静  尹依恒
作者单位:安徽理工大学医学院,安徽 淮南 232001;同济大学附属上海市第十人民医院心内科,上海 200072,安徽理工大学医学院,安徽 淮南 232001,同济大学附属上海市第十人民医院心内科,上海 200072
摘    要:
利用基因表达综合数据库数据集的生物信息学分析,确定4h内STEMI患者血液RNA诊断生物标志物。从基因表达综合数据库中提取RNA表达谱数据集,寻找差异表达基因并对差异基因进行富集分析,在蛋白相互作用网络中筛选Hub基因,建立了基于Hub基因的随机森林模型和逻辑回归模型。结果表明,与健康对照组比较,STEMI患者中鉴定出300个明显DEGs。炎症和免疫相关的途径显著富集,鉴定出7个关键基因,即FPR2、ITGAM、BST1、CEACAM8、MMP9、ELANE和FPR1。通过对7个Hub基因构建随机森林模型和逻辑回归模型,准确地将STEMI样本与健康对照样本分开,对STEMI的预测具有较高的准确性。

关 键 词:急性ST段抬高型心肌梗死  差异表达基因  Hub基因

Identification of Pathways and Hub Genes in Patients with Acute ST-segment Elevation Myocardial Infarction by Using Bioinformatic Analysis
LIU Zheng,WANG Zhicai,CANG Yan,QIAN Yunyun,LIU Jing,YIN Yiheng. Identification of Pathways and Hub Genes in Patients with Acute ST-segment Elevation Myocardial Infarction by Using Bioinformatic Analysis[J]. Journal of Anhui University of Science and Technology:Natural Science, 2022, 42(1): 93-98. DOI: 10.3969/j.issn.1672-1098.2022.01.015
Authors:LIU Zheng  WANG Zhicai  CANG Yan  QIAN Yunyun  LIU Jing  YIN Yiheng
Abstract:
Keywords:
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