| 桃钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶基因家族鉴定与分析 |
| |
| 作者姓名： | 张杰伟 杨育峰 任飞 谢华 魏建华 |
| |
| 作者单位： | 北京市农林科学院 农业基因资源与生物技术北京市重点实验室,河南省农业科学院,北京市农林科学院 农业基因资源与生物技术北京市重点实验室,北京市农林科学院 农业基因资源与生物技术北京市重点实验室,北京市农林科学院 农业基因资源与生物技术北京市重点实验室 |
| |
| 基金项目： | 北京市农林科学院青年科研(QNJJ201416);北京市科技计划(Z151100001015005);北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20140202) |
| |
| 摘 要： | 钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶(CIPKs)在植物生长发育和抗逆过程中发挥着重要作用。为了对桃中CIPK家族基因进行系统分析,利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃CIPK家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析。结果表明,桃基因组中含有18个CIPK基因,分布于桃的6条染色体上。MEME和Pfam保守结构域分析显示,桃CIPK蛋白均含有2个保守的PKinase和NAF结构域。进化树分析表明CIPKs可分为2个亚家族。Net Phos 2.0 Server结果显示Pp CIPKs存在着大量的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)及酪氨酸(Tyr)潜在磷酸化位点。以上结果将为今后揭示桃CIPK蛋白的功能提供重要的理论基础。
|
| 关 键 词： | 钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶 桃 基因家族 进化分析 |
| 收稿时间： | 2016-03-22 |
| 修稿时间： | 2016-04-29 |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《科学技术与工程》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《科学技术与工程》下载免费的PDF全文 |
|
