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基因组AFLP分析及线粒体12SrRNA序列变异在笛鲷科系统发育上的比较
引用本文:张俊彬,刘昕.基因组AFLP分析及线粒体12SrRNA序列变异在笛鲷科系统发育上的比较[J].科学通报,2006,51(B11):120-124.
作者姓名:张俊彬  刘昕
作者单位:中国科学院广东省海洋应用生物技术重点实验室、中国科学院南海海洋研究所热带海洋环境动力学开放实验室,广州510301
基金项目:本工作为国家自然基金项目(批准号:40306022)和广东省自然科学基金项目(编号:04001300)资助.
摘    要:以10种笛鲷科鱼类和1种纵带裸颊鲷为对象,采用ABI PRISM 310测序仪进行基因组AFLP分析,并结合线粒体12S rRNA序列变异对笛鲷科系统发育开展比较研究.结果显示:除了紫鱼属和梅鲷属鱼类外,这两种方法构建的最小进化树(ME)的拓扑结构基本上是一致的,而且具有较高的自展值(bootstrap),其揭示的笛鲷科系统发育关系也为最大似然法(ML)支持.基于线粒体12S rRNA序列进行最大似然法分析表明,笛鲷科系统发育最适合的替代模型为TrN+G,对数似然比检验表明,分子钟是被接受的.AFLP遗传标记适合于笛鲷科及以下水平的系统发育分析.研究表明,笛鲷属可能为一单系,但其他属的系统发育关系还需要更多资料进一步验证.

关 键 词:笛鲷科  系统发育  基因组  线粒体  12S  rRNA  AFLP
收稿时间:2006-02-27
修稿时间:2006-02-272006-07-27
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