| SARS相关病毒(BJ01株)的全序列及其比较分析 |
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| 引用本文： | 秦鄂德,祝庆余,于曼,范宝昌,常国辉,司炳银,杨保安,彭文明,姜涛,刘伯华,邓永强,刘洪,张雨,王翠娥,李豫川,甘永华,李晓萸,吕富双,谭刚,曹务春,杨瑞馥,汪建,李蔚,徐祖元,李彦,吴清发,林伟,陈维军,唐琳,邓亚军,韩玉军,李昌峰,雷蒙,李国庆,李文杰,吕宏,石建萍,童宗中,张峰,李松岗,刘斌,刘斯奇,董伟,王俊,黄家树,于军,杨焕明.SARS相关病毒(BJ01株)的全序列及其比较分析[J].科学通报,2003,48(11):1127-1134. |
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| 作者姓名： | 秦鄂德 祝庆余 于曼 范宝昌 常国辉 司炳银 杨保安 彭文明 姜涛 刘伯华 邓永强 刘洪 张雨 王翠娥 李豫川 甘永华 李晓萸 吕富双 谭刚 曹务春 杨瑞馥 汪建 李蔚 徐祖元 李彦 吴清发 林伟 陈维军 唐琳 邓亚军 韩玉军 李昌峰 雷蒙 李国庆 李文杰 吕宏 石建萍 童宗中 张峰 李松岗 刘斌 刘斯奇 董伟 王俊 黄家树 于军 杨焕明 |
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| 作者单位： | 1. 军事医学科学院微生物学与流行病学研究所,北京,100071
2. 中国科学院北京基因组研究所/生物系统工程国家工程研究中心,北京,101300 |
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| 基金项目： | 感谢科学技术部、中国科学院、国家自然科学基金委员会的经费支持. |
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| 摘 要： | 严重急性呼吸综合征(SARS)是一种新发现的急性传染病. 对一株已确认为SARS病原体的冠状病毒(BJ01)进行了全基因组序列测定, 并与其他已知病毒进行了比较分析. 该病毒基因组全长为29.725 kb, 含11个可读框(ORFs), 由1个稳定区和1个可变区组成, 其中稳定区编码RNA依赖性RNA聚合酶, 包括两个ORFs；可变区含有4个蛋白质编码序列(CDSs), 分别编码病毒的4个结构蛋白(S, E, M, N蛋白). 此外, 可变区还包括5个非典型的预测蛋白(PUPs). 此病毒基因的排列顺序与其他已知的冠状病毒一致. 通过与已知RNA病毒的序列比对, 可以确认该病毒属于冠状病毒科(Coronaviridae). 与GenBank中已知的5个SARS相关病毒全基因组序列的比较分析显示, 已在30个核苷酸位置上检出序列差异, 总体突变率为0.1%, 其中15个变异位点在编码区, 可能会导致蛋白质的氨基酸改变(异义突变). S蛋白中已发现3处可能引起该蛋白质物化特征变化的变异, 而该蛋白质可能参与病毒与宿主间的免疫反应. 与病毒包膜形成相关的M蛋白中则已发现两处氨基酸变化. 进化分析表明, SARS病毒可能不是来源于人类, 但没有证据证明是人为制造的. 为了阐明SARS相关病毒的病因学以及排除其他可能的SARS病原体的存在, 仍需进行更深入的研究.
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| 关 键 词： | 严重急性呼吸综合征(SARS) 冠状病毒 基因组 系统发生学 突变 |
| 收稿时间： | 2003-04-29 |
| 修稿时间： | 2003年4月29日 |
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