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酵母全基因组新的ORF结构的预测
引用本文:李宏,罗辽复. 酵母全基因组新的ORF结构的预测[J]. 内蒙古大学学报(自然科学版), 2001, 32(5): 498-503
作者姓名:李宏  罗辽复
作者单位:内蒙古大学理论物理和理论生物学研究室
基金项目:国家自然科学基金 ( 39660 0 35 ),内蒙古教育厅重点基金项目资助
摘    要:提出了一个预测DNA序列中无内含子的开阅读框架(ORF)的理论方法-终止密码预测法;用酵母全基因组中已知的6260个基因进行检验,预测成功率为99.9%;发现酵母基因编码区和已知的DRF的起始密码子总是位于长距离不出现终止密码的位置序列上游紧邻最后一个终止密码子的ATG;在酵母全基因组DNA中发现了新的长度不小于90个氨基酸的ORF结构2244个。

关 键 词:终止密码方法 酵母基因组 开放阅读框架 结构预测 DNA序列 基因检验
文章编号:1000-1638(2001)05-0498-06
修稿时间:2000-08-31

Predicting New ORFs in Yeast Genome
LI Hong,LUO Liao fu. Predicting New ORFs in Yeast Genome[J]. Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Neimongol, 2001, 32(5): 498-503
Authors:LI Hong  LUO Liao fu
Abstract:A method for predicting first kind of open reading frame (ORF) is given,which is called Terminal Codon Method.The first kind of ORFs is the ORF that has not intron in it.The correctness of the method is examined by 6 260 known genes and ORFS of yeast genome and its successful rate is 99.9%.This result shows that the starting codon of yeast gene is always the ATG which is in close neighbor to the last terminal codon upstream.2 244 new ORFs with length not lower than 90a.a have been found.
Keywords:Terminal Codon method  Yeast genome  open reading frame  predicting
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