| 水曲柳FmGT8家族基因生物信息及表达模式分析 |
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| 引用本文： | 周姗,詹亚光,董恒,刘婧婧,曾凡锁.水曲柳FmGT8家族基因生物信息及表达模式分析[J].南京林业大学学报(自然科学版),2016,59(2):27-32. |
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| 作者姓名： | 周姗 詹亚光 董恒 刘婧婧 曾凡锁 |
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| 作者单位： | 东北林业大学生命科学学院,黑龙江 哈尔滨 150040 |
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| 基金项目： | “十二五”国家科技支撑计划(2012BAD21B0201－7)；国家重点实验室创新项目(2013B04) |
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| 摘 要： | 为研究水曲柳糖基转移酶8家族(glycosyltransferases,FmGT8)基因结构特征及编码蛋白性质,揭示其时空表达模式以及对应拉处理的响应机制,在获得4个水曲柳FmGT8基因的基础上,应用生物信息学软件对FmGT8及其编码蛋白进行详细的分析; 选择5—9月的水曲柳叶子、木质部以及外皮样本,利用实时荧光定量PCR分析FmGT8基因的表达模式; 对水曲柳分别进行1、3、7 d的应拉处理,分析FmGT8基因转录表达对应拉处理的响应模式。结果显示:获得了3个FmGT8全长基因(FmGT8-1,FmGT8-2,FmGT8-3)和1个FmGT8基因片段(FmGT8-4),已上传至NCBI并获得登录号分别为KP307672、KP307673、KP307674、KP307675。FmGT8-1、FmGT8-2、FmGT8-3在木质部中表达量最高,FmGT8-4在外皮中的表达量最高; FmGT8-1、FmGT8-2、FmGT8-3均在6月的相对表达量达到最高,FmGT8-4在9月表达量最高。4个基因在应拉处理材料中的表达模式各不相同,但均对应拉处理有响应。FmGT8-1、FmGT8-2、FmGT8-4在应拉受力面的表达量最高,FmGT8-3在应压受力面表达量最高,说明FmGT8具有时空特异性。研究结果表明FmGT8家族基因可能参与了细胞壁与木质素的合成。
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| 关 键 词： | 水曲柳 FmGT8 时空表达 应拉木 生物信息学 |
Bioinformation and expression pattern analysis of FmGT8 gene family in Fraxinus mandshurica |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Fraxinus mandshurica FmGT8 temporal and spatial expression tension wood bioinformatics |
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