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α-1,6-岩藻糖基转移酶的生物信息学分析
引用本文:王子豪,钱荣凯,苏林杰,贾宁,孙钦儒.α-1,6-岩藻糖基转移酶的生物信息学分析[J].科学技术与工程,2021,21(30):12832-12837.
作者姓名:王子豪  钱荣凯  苏林杰  贾宁  孙钦儒
作者单位:西安交通大学
基金项目:国家自然科学基金青年项目(31200843), 陕西省重点研发计划(2020SF-133,2021SF-097); 陕西省自然科学基础研究计划(2017JM8017); 中国博士后基金特别资助(2018T111074); 中国博士后基金面上(2017M623190);陕西省博士后科研项目(2018BSHERZZ97)
摘    要:目的:核心岩藻糖糖基化作为一种较常见N-糖基化,是重要的翻译后修饰机制,可以快速改变蛋白质的生物学性质,在哺乳动物细胞识别、增殖以及代谢活动中具有重要的作用。在人类,α1,6-岩藻糖基转移酶(FUT8)是此修饰过程的唯一蛋白。本文利用生物信息学分析FUT8蛋白的编码基因结构、蛋白质的氨基酸序列特征和三维结构的信息,解析其生物学功能。方法:利用NCBI生物信息数据库及在线工具分析fut8基因的结构及表达调控特点;分析FUT8蛋白的理化性质、跨膜结构域、立体结构、蛋白相互作用网络及通路,明确其生物功能及其在相关疾病中的作用。结果:编码FUT8的人类fut8基因位于14q23.3,转录产物最长3895 bp,共编码氨基酸575个,产物FUT8为弱碱亲水性,存在由内向外的跨膜区段,二级结构元件以α螺旋为主,可分为4个结构域,与多种蛋白质及受体存在相互作用,催化蛋白质核心岩藻糖基化的形成,序列比对表明FUT8存在多个保守域并在物种进化中高度保守。结论:利用生物信息数据库及工具成功获取人FUT8蛋白的理化性质、跨膜域信息、立体结构,以及其与多种蛋白的相互作用网络,为未来进一步研究FUT8在肥胖及相关疾病、肿瘤转移炎症及免疫和造血异常中的作用提供理论依据。

关 键 词:α1  6-岩藻糖基转移酶    fut8基因    FUT8蛋白的结构和功能    生物信息学
收稿时间:2020/5/26 0:00:00
修稿时间:2021/9/4 0:00:00

Bioinformatic analysis of FUT8
Wang Zihao,Qian Rongkai,Su Linjie,Jia Ning,Sun Qinru.Bioinformatic analysis of FUT8[J].Science Technology and Engineering,2021,21(30):12832-12837.
Authors:Wang Zihao  Qian Rongkai  Su Linjie  Jia Ning  Sun Qinru
Institution:Xi''an Jiaotong University
Abstract:
Keywords:1  6-fucosyltransferase  fut8 gene  Structure and Function of FUT8 protein  Bioinformatics
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