| 从大豆疫霉菌ESTs中发掘SSR标记 |
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| 引用本文： | 朱振东,霍云龙,王晓鸣,黄俊斌,武小菲.从大豆疫霉菌ESTs中发掘SSR标记[J].科学通报,2004,49(17):1749-1754. |
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| 作者姓名： | 朱振东 霍云龙 王晓鸣 黄俊斌 武小菲 |
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| 作者单位： | 1. 中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,100081
2. 中国农业科学院作物品种资源研究所,北京,100081;华中农业大学植物保护系,武汉,430070
3. 华中农业大学植物保护系,武汉,430070 |
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| 基金项目： | 本工作为国家重点基础研究发展规划(批准号:2002CB111406)、国家自然科学基金(批准号:30170586)和国家"十五"科技攻关专题(批准号:2001BA509B0608)资助项目. |
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| 摘 要： | 通过对5800条大豆疫霉菌EST进行电子查询, 在369条EST中发现415个SSR. 在筛选的EST序列中SSR平均密度为每 8.9 kb含有1个SSR. 在鉴定的SSR中, 三核苷酸重复基元的SSR类型最多, 占鉴定总数的50.1%, 四核苷酸重复基元的SSR类型最少, 为8.2%. 设计40个SSR引物对对5个大豆疫霉菌菌株基因组DNA进行PCR扩增, 有33个引物对扩增出SSR特征条带, 其中有28个引物对扩增出在预期片段大小范围之内的条带. 在33个功能性引物对中, 有15个引物对在5个大豆疫霉菌菌株间扩增出多态性, 多态性引物对占45.5%. 基于SSR标记进行聚类分析, 可将5个检测大豆疫霉菌菌株划分为不同的3个组. 本研究建立了大豆疫霉菌的SSR标记, 为大豆疫霉菌及相关属种的鉴定、遗传变异、分子作图等研究提供了一种更加有效的分子标记系统.
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| 关 键 词： | 表达序列标签 SSR标记 大豆疫霉菌 大豆 |
| 收稿时间： | 2004-06-03 |
| 修稿时间： | 2004-08-16 |
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